Para UZEI, al menos en un principio, la lexicografía no era uno de sus objetivos. Sin embargo, en 1986, surgió este departamento debido a la labor lexicográfica que comenzó a desempeñar un equipo como apoyo a la Real Academia de la Lengua Vasca (Euskaltzaindia). La Comisión de Lexicografía de la Academia vio la necesidad de un corpus que reflejara el euskera actual y fue UZEI quien llevó a cabo esta tarea. Desde entonces, además de inventariar todo lo que se publica en euskera y, partiendo de ahí, completar el muestreo estadístico que será la base para el corpus, el Departamento de Lexicografía prepara los informes que recogen el historial de las formas a tratar por la Comisión de la Academia.